麻帆良祭を準備する生徒達で賑わい、大盛り上がりの麻帆良学園。 ところが学園内が突如不気味な魔力に包まれ始める…。異変に気付いたネギ くんは学園長に頼まれて学園内を調べることに。しかし、次々と消えるネギ くんの生徒たち。準備中のアトラクションは謎の魔力でダンジョンと化し、 生徒たちはその奥に閉じこめられてしまった。そして忍び寄るモンスターの 影。学園内を探索したり、モンスター退治に大忙しのネギくん…。数々の謎 を解き明かし、無事に学園を守ることができるのだろうか!?